Los Cleft Oscuros (Dark Cleft en inglés) son Cleft sombra que viven en las mazmorras 13, 14 y 25 de Las 100 Mazmorras de Villacruz. Aparecen únicamente en Super Paper Mario. Tienen una defensa muy alta, (en realidad, la mejor defensa de todos los enemigos en el juego), pero Bumbún pueden darle la vuelta, bajando su defensa a 0. Al igual que sus parientes, los Cleft oscuros se disfrazan de rocas, sin embargo, su mimetismo es algo inútil, ya que son completamente negro. Tienen 10 Puntos de Corazón, 4 puntos de ataque y 11 puntos de defensa.